يؤدي الدكتور أيمن بهاء الدين اليمين الدستوي كنائب لوزير التربية والتعليم لشئون التعليم الفني.
وشغل الدكتور أيمن بهاء الدين عدة مناصب إدارية في العديد من المؤسسات الحكومية والخاصة كالآتى:
- شغل منصب رئيس جامعة السويدي للتكنولوجيا.
- شغل منصب أستاذ شبكات الحاسب بجامعة عين شمس.
- شغل عدة مناصب قيادية، والانضمام إلى SUT -البوليتكنيك في مصر.
- شغل منصب عميد كلية علوم الحاسوب ورئيس مجلس شؤون الطلاب في جامعة مصر الدولية.
- شغل عام ٢٠٠٤ عمل كأستاذ متفرغ في في كل من الجامعة البريطانية والأكاديمية العربية للعلوم والتكنولوجيا.
- المدير العام لشبكة الجامعات المصرية (EUN) من مايو ٢٠١٠ - حتى أبريل ٢٠١٤.
- شغل منصب المدير العام لمركز مصر لريادة الأعمال والابتكار عام ٢٠١٥.