احتفظ الدكتور سيد إسماعيل، بمنصبه نائبا لوزير الإسكان والمرافق والمجتمعات العمرانية في الحكومة الثانية للدكتور مصطفى مدبولي، التي تؤدي اليمين الدستورية اليوم.
عمل إسماعيل منذ ديسمبر 2019 نائبا لوزير الإسكان لشئون البنية الأساسية ورئيسا لوحدة إدارة المشروعات بالوزارة.
وأشرف الدكتور سيد إسماعيل، من خلال وحدة إدارة المشروعات، على برنامج خدمات الصرف الصحي المستدامة بالمناطق الريفية، الذي يستهدف حصد عددا من الجوائز آخرها أفضل مشروع في مجال البنية التحتية لعام 2024 من معرض Big 5 Construct Egypt.
كما حصد مشروع إنشاء منظومة مياه مصرف بحر البقر جائزة أفضل مشروع تنموي لعام 2023، تحت رعاية الصندوق العربي للإنماء العربي والاقتصادي.
وشارك إسماعيل في إعداد قانون تنظيم مرفق مياه الشرب والصرف الصحي، وفي وضع الكود المصري لأنظمة الصرف الصحي بالمناطق الريفية.
ومثّل وزارة الإسكان في العديد من الفعاليات والمؤتمرات الدولية للحديث عن مشروعات المرافق، كما بحث مع مسئولي شركات كبرى توطين عدد من الصناعات المرتبطة بمشروعات مياه الشرب والصرف الصحي.